尊敬的[对方单位/个人名称]：

您好！

首先，感谢您对我们工作的关注和支持。近期我们注意到，贵方在某些方面对我们的工作存在一些疑问或误解。为了确保双方能够准确理解彼此的立场和意图，避免不必要的误会，现就相关事项进行澄清，并希望通过此函达成共识。

一、关于[具体问题描述]

根据我们的了解，贵方可能认为[具体问题描述]。对此，我们需要说明的是，实际情况并非如此。具体来说：

- [详细说明事实背景]

- [列举相关证据或数据支持]

二、关于[其他问题描述]

此外，针对贵方提出的另一项疑问——[具体问题描述]，我们也希望予以明确说明：

- [详细解释原因]

- [提供必要的补充信息]

三、下一步合作计划

基于上述澄清，我们真诚希望能够继续与贵方保持良好的合作关系。为此，我们建议采取以下措施：

1. [具体建议一]

2. [具体建议二]

3. [具体建议三]

最后，再次感谢贵方对我们的关心与支持。如果您还有任何疑问或需要进一步沟通，请随时通过以下方式与我们联系：

联系电话：[电话号码]

电子邮箱：[邮箱地址]

期待您的回复，并希望能共同推动双方关系向更健康的方向发展。

此致

敬礼

[您的单位名称]

[日期]

以上为问题澄清函的范文模板，可根据实际情况调整具体内容。希望对您有所帮助！